Отдел образования АО «ННКЦ» функционирует с октября 2011 года и осуществляет подготовку современных высокоспециализированных кадров для системы здравоохранения РК. В отделе образования идет постоянная работа над учебно-методической документацией, направленная на их обновление в соответствии с быстрыми темпами развития новых медицинских технологий и научными достижениями. Обучение ориентировано на овладение профессиональными навыками на практических занятиях и во время производственной практики. Проводятся мастер-классы с привлечением ведущих специалистов из дальнего и ближнего зарубежья.

Качество освоения практических навыков систематически контролируется на всех этапах обучения, после окончания курсов выдаются сертификаты государственного образца

• Организация проведения мероприятий по международному сотрудничеству, в том числе по 059 бюджетной программе «Повышение потенциала и внедрение высокотехнологических методов диагностики и лечения заболеваний»
• Организация и проведению образовательных мероприятий (циклов повышения квалификации, стажировок на рабочем месте и переподготовки, семинаров, мастер-классов и др.) специалистов Общества, государственных и негосударственных организаций здравоохранения с регионов РК (на бюджетной и на договорной основе),физ. лицами, проводимых на базе Общества;
• Организация и контроль по послевузовскому образованию (резидентура);
• Организация мероприятий в рамках Центра передовых знаний;
• Организация работы Информационно-ресурсного центра.