Отдел науки АО «Национальный научный кардиохирургический центр» осуществляет организацию, координацию и планирование научной деятельности. 

Клинические исследования и научные проекты проводится согласно действующим законодательством Республики Казахстан, международным научным стандартам GCP и JCI. 

Современные международные стандарты проведения клинических исследований с участием пациентов в качестве обязательного требования включают экспертизу в Этическом комитете и на Ученом совете. В связи с этим, в Центре активно функционирует Этический комитет и Ученый совет.  

Этический комитет
Этический комитет АО «ННКЦ» является независимым органом осуществляющий защиту прав, безопасности и благополучия пациентов, испытуемых и исследователей. 

Ученый совет
Ученый совет является высшим координационным консультативно-совещательным органом, в состав которого входят ведущие врачи и научные сотрудники Центра. Председателем Ученого совета является Пя Юрий Владимирович.